- Văn phòng UBND tỉnh
- Sở Tài chính tỉnh Ninh Bình
- Sở Nội vụ tỉnh Ninh Bình
- Sở Khoa học và Công nghệ tỉnh Ninh Bình
- Sở Công thương tỉnh Ninh Bình
- Sở Ngoại vụ tỉnh Ninh Bình
- Sở Nông nghiệp và Môi trường tỉnh Ninh Bình
- Sở Tư pháp tỉnh Ninh Bình
- Sở Xây dựng tỉnh Ninh Bình
- Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Ninh Bình
- Sở Y tế tỉnh Ninh Bình
- Sở Du lịch tỉnh Ninh Bình
- Sở Văn hóa và Thể thao tỉnh Ninh Bình
- Thanh tra tỉnh Ninh Bình
- Ban Quản lý Khu kinh tế và các khu công nghiệp tỉnh
- Ban Quản lý Khu đại học Nam Cao và khu công nghệ cao
